Vzroki za prhljaj so lahko različni. Eden od glavnih vzrokov je pretirano izločanje sebuma (naravno olje), ki ga povzročajo različni dejavniki, vključno s hormonskimi spremembami, stresom, nezdravo prehrano ali slabo higieno lasišča. Prekomerno izločanje sebuma spodbuja rast glivice Malassezia, ki je običajno prisotna na lasišču, vendar se pri prhljaju lahko prekomerno namnoži.

Drugi vzroki prhljaja vključujejo suho lasišče, pogosto pranje las s škodljivimi šamponi ali uporabo preveč agresivnih izdelkov za nego las, alergijske reakcije na določene sestavine v izdelkih za nego lasišča, nepravilno česanje ali uporabo preveč vročega zraka pri sušenju las.
Prhljaj je lahko tudi posledica določenih kožnih bolezni, kot je seboreični dermatitis, ki povzroča vnetje in luščenje kože na lasišču.